治疗湿疹
夏天皮肤容易出现问题，一个是因为潮湿，还有一个如果自身湿气太重，也会有所表现，比如皮肤上出现湿疹，还有过敏。这个时候就可以将藿香正气水直接涂抹在身上，或者在洗澡的时候兑在水中，之后不要清洗，尽量让药液自然干燥。这个过程就可以产生局部治疗的效果。
去头癣、手足癣和灰指甲
藿香正气水中的藿香、紫苏、白芷、桔梗分别对多种致病真菌有较强的抑制作用，故而对头癣、手足癣、灰指甲有较好的疗效。将适量藿香正气水滴入洗澡水中，用来泡澡，可以有效的治疗真菌引起的疾病，也可用藿香正气水涂擦患处，
去痱子
中医认为痱子由表热夹湿引起，而藿香正气水有解表祛热除湿的功效，所以对痱子有良效，配合止汗爽身粉疗效更佳。尤其对于小孩子来说，可以在他们的洗澡水中滴入几滴藿香正气水，可以有效的防止小孩长痱子。
治疗外阴瘙痒
因藿香正气水是由抗多种致病菌和杀滴虫的藿香、紫苏、白芷、生姜等药组成，故治疗外阴痞痒有较好的疗效。以藿香正气水：兑凉开水清洗外阴，男女皆可用。不但有止痒疗效，而且有一种清爽感。因此，藿香正气水的稀释液也可以充作性器官的保健清洗剂。
抑菌、抗病毒
厚朴有广泛抗菌作用，其抗菌成分较稳定，不易被热、酸、碱等所破坏。试验证明，其对金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、痢疾杆菌等均有抑制作用。紫苏对大肠杆菌、痢疾杆菌、葡萄球菌等亦有抑制作用。藿香所含广藿香酮则对金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、大肠杆菌、痢疾杆菌、甲型溶血性链球菌、肺炎双球菌，均有抑制作用。
