超声波理疗往往是选择赫兹800赫兹到1000赫兹的频率是的声波进行疾病治疗。这种频率的超声波往往不会吃人的听觉产生反应，但是可以对于一些疾病进行治疗。目前超声波理疗已经应用于癌症的治疗，并且还可以用于某些泌尿系统结石疾病的碎石治疗。并且随着医疗技术的不断发展，超声波理疗的应用范围还在不断扩展。
超声波理疗的具体机制可以是机械性的，也可以是温热性的。机械作用是超声波的一种基本的原发的作用。超声波在介质内传播过程中介质质点交替压缩与伸张形成交变声压，不仅可使介质质点受到交变压力（在治疗剂量下，每一细胞均受4－8mg压力变化影响）及获得巨大加速度而剧烈运动，相互摩擦，而且能使组织细胞产生容积和运动的变化。
超声波理疗的温热作用主要是利用超声波来使得身体产生热量，有些人甚至称为“超声透热疗法”。超声波在机体内热的形成，主要是组织吸收声能的结果。
之所以可以通过超声波理疗来治疗疾病，这是因为在超声波的温热作用或者是机械作用下，身体内部氢离子的浓度可能发生改变，并且还可以使得身体酶活性受到影响，并且通过这种理疗方式可以进一步影响到身体蛋白质合成，还可以刺激身体组织细胞不断生长。这种理疗方式另外一个作用是使得身体内部氧化还原反应得到加强。
