甲状腺抗体的测定主要有甲状腺球蛋白抗体、甲状腺过氧化物酶抗体、促甲状腺激素TSH受体抗体，前两者阳性（增高）有助于桥本氏甲状腺炎的判断，而TSH受体抗体阳性（增高）常见于毒性弥漫性甲状腺肿（甲亢Graves)。
1、甲状腺球蛋白抗体(TgAb）是甲状腺免疫损伤的标志，一般认为与甲状腺功能状态没有关系，就是说这一指标不能作为判断甲状腺功能有没有恢复的依据。甲状腺球蛋白抗体增高有助于桥本氏甲状腺炎的诊断。
2、甲状腺微粒体抗体中有一种叫做甲状腺过氧化物酶抗体(TROAb)，其作用相当重要，是甲状腺的主要的破坏性抗体，在自身免疫性甲状腺疾病中，水平升高，是对甲状腺细胞主要的破坏性抗体。一般检查甲状腺过氧化物酶抗体就不用检查甲状腺微粒体抗体了。这一指标是检测自身免疫性甲状腺疾病最敏感的方法，大部分桥本氏甲状腺炎和甲亢含有甲状腺过氧化物酶抗体TPOAb是增高的，但是桥本氏甲状腺炎含量高于甲亢。
3、促甲状腺激素TSH受体抗体（TRAb）包含两种抗体：一种是促甲状腺激素刺激性抗体和促甲状腺激素抑制性抗体，据统计，90%以上的甲亢Graves呈阳性，就是增高，因此此指标可以作为诊断甲亢Graves的指标。
