海门市中医院始建于1959年，现位于海门镇公园巷12号，地处海门市中心，毗邻全市最大的休闲绿地——东洲公园。是一所具有多项医疗特色的二级甲等中医医院，是南京中医药大学等多所医药院校的教学实习医院。1995年通过中管局二级甲等中医医院的评审，2009年、2013年通过二甲中医医院复核评审。2016年12月与上海市第一人民医院合作签约，成为上海市第一人民医院海门分院；2017年2月与上海中医药大学附属龙华医院合作签约，成为上海龙华医院合作共建医院。
医院占地面积30亩，建筑面积3.1万平方米，科室设置齐全，共有一级临床和医技科室14个，二级临床科室13个，住院部共有13个病区，核定床位499张。7个净化手术间，1个重症监护病房和1个血透室。急诊科分急诊抢救、输液室、和留观病房，功能齐全。门诊内外妇儿科分类齐全，并设有中医特色的综合治疗区。
医院现有职工682人，其中专业技术人员593人，具有高级职称者62人；高学历人才不断增加，现有医学硕士共30人。江苏省名老中医1人，享受国务院特殊津贴1人，南通市名中医3人，在省市各学会任职有48人。医院心病科、外科和妇科为南通市中医重点专科；肾内科和脾胃科（消化内科）为南通市中医重点建设专科。近几年，医院五项科研项目获南通市及海门市科技进步奖，有三项分获南通市新技术引进一、二、三等奖，近三年发表论文150余篇。中医药诊疗形成特色优势，门诊开设中医堂、引进体质辨识系统、开展多种类中医特色诊疗和护理。中医治未病形成品牌，冬病夏治药物敷贴和冬季膏滋养生享誉市内外，每年接待上万群众。
医院各种医疗设备先进齐全。医院拥有GE1.5T核磁共振、东芝16排螺旋CT、东芝A plio-770彩超、日立全自动生化分析仪、最新型奥林巴斯电子染色胃肠镜系统、数字胃肠机、DR、CR、原装进口微创设备（电视腹腔镜、胆道镜、宫腔 镜、阴道镜、膀胱镜、关节镜、输尿管镜、超声刀）、肿瘤放射性粒子组织间植入系统、冷极射频治疗系统、高频热疗仪、全自动血透机、全自动呼吸机、自动煎药 机等各类先进的医疗仪器设备。今年还将投入近2千万，彩超、关节镜、能量止血平台、腹腔镜、信息系统等。
医院近十年来多次被评为南通市“十佳”医院、南通市先进集体、文明单位、海门市先进集体、文明单位、南通市基层党建示范点、南通市无红包医院等荣誉称号。
