一、大便常规：
大便常规的检验目的主要有了解消化道有无细菌感染以及寄生虫感染和潜血试验。
二、外周血：
外周血是除骨髓之外的血液，临床上常用一些方法把骨髓中的造血干细胞释放到血液中，再在从血液中提取分离得到造血干细胞，我们把这样得到的干细胞成为外周血干细胞。
必要时查白细胞及分类以除外炎症感染。
三、X线检查：
腹部平片以观察肠淤胀与游离气体。必要时做钡餐或钡灌肠以观察有无溃疡、胃炎、十二指肠炎、肠粘连、肠梗阻或憩室。
四、胃镜检查：
胃镜检查的全名为“上消化道内视镜检查”，它是利用一条直径约一公分的黑色塑胶包裹导光纤维的细长管子，前端装有内视镜由嘴中伸入受检者的食道→胃→十二指肠，藉由光源器所发出之强光，经由导光纤维可使光转弯，让医师从另一端清楚地观察上消化道内各部位的健康状况。
必要时，可由胃镜上的小洞伸入夹子做切片检查。全程检查时间约10分钟，若做切片检查，则需20至30分钟。对于慢性反复发作的腹痛进行胃镜检查有助于全面发现胃部病变如胃炎、十二指肠炎、溃疡病等。
五、胃电图检查：
因是无创性检查患儿易于接受，但所得结果特异性不强，仅能作参考。
六、幽门螺杆菌检查：
幽门螺杆菌感染是慢性活动性胃炎、消化性溃疡、胃黏膜相关淋巴组织(MALT) 淋巴瘤和胃癌的主要致病因素。1994年世界卫生组织/国际癌症研究机构 (WHO/IARC) 将幽门螺杆菌定为Ⅰ类致癌原。
对慢性反复发作腹痛有密切关系，如发现幽门螺杆菌应给予治疗。
七、胃动力学检查：
如食管与十二指肠测压、实时超声、胃排空试验，有助于发现消化道动力障碍。
