(一)前鼻孔镜检查 鼻粘膜收敛后，经前鼻孔镜可窥到后鼻孔和鼻咽部，能发现侵入或邻近鼻孔的癌肿。
(二)间接鼻咽镜检查 方法简便、实用。应依次检查鼻咽的各壁，注意鼻咽顶后壁及两侧咽隐窝，要两侧相应部位对照观察，凡两侧不对称的粘膜下隆起或孤立性结节更应引起注意。
(三)纤维鼻咽镜检查 进行纤维鼻咽镜检查可先用1%麻黄素溶液收敛鼻腔粘膜扩张鼻道。再用1%地卡因溶液表面麻醉鼻道，然后将纤维镜从鼻腔插入，一面观察，一面向前推进，直到鼻咽腔。本法简便、镜子固定好，但后鼻孔和顶前壁观察不满意。
(四)颈部活检 对已经鼻咽活检未能确诊的病例可进行颈部肿块活检。一般均可在局麻下进行，术时应选择最早出现的硬实淋巴结，争取连包膜整个摘出。如切除活检确有困难，可在肿块处作楔形切取活检，切取组织时须有一定深度，并切忌挤压。术毕时术野不宜作过紧过密的缝合。
组织病理学检查 在有肿块处或怀疑有肿瘤区咬取组织，受累淋巴结也应取出进行病理学诊断。鳞状细胞癌胞体大，细胞间桥可见，故细胞边界清楚。胞质多，嗜酸性，部分角化;核明显，染色深，核异形性大，核分裂可见。在癌巢中心部分细胞角化，形成角化珠。根据角化程度或角化珠多少以及细胞间桥的数量可将鳞状细胞癌分为高度、中度和低分化3类。鼻咽、口咽鳞状细胞癌的特殊类型为淋巴上皮瘤(lymphoepithelioma)，分化差，甚至在原发灶以前可能已侵犯眼眶，发生淋巴转移。有时原发灶很小，定位活检困难，多数盲目活检可能揭示原发灶。1/3的患者有一定程度的颅底破坏，多数脑神经受损，最先为展神经损害，以后其他神经瘫痪。淋巴上皮瘤又分为两个亚型：
(1)Regaud型：细胞大、分化差，核呈圆形或椭圆形，空泡状，核分裂多的癌细胞呈条索或小梁状分布在丰富的淋巴基质中。
(2)Schmincke型：类似于网状细胞退行性变的癌细胞，呈小巢或团状分散在淋巴基质中。
这两型缺乏角化，故诊断困难。但电子显微镜见细胞质内有张力原丝和细胞间桥粒连接，Keratin染色阳性可证实来自上皮。
(五)细针穿刺抽吸 这是一种简便易行，安全高效的肿瘤诊断方法，近年来较为推祟。对疑有颈部淋巴结转移者可首先使用细针穿刺取得细胞。具体方法如下：
1.鼻咽肿物穿刺：用7号长针头接于注射器上。口咽部麻醉后，在间接鼻咽镜下将针头刺入肿瘤实质内，抽取注射器使成负压，可在肿瘤内往返活动两次，将抽取物涂于玻片上做细胞学检查。
2.颈部肿块的细针穿刺：用7号或9号针头接于10m1注射器上。局部皮肤消毒后，选择穿刺点，沿肿瘤长轴方向进针，抽吸注射器并使针头在肿块内往返活动2～3次，取出后将抽吸物做细胞学或病理学检查。
(六)EB病毒血清学检测 目前普遍应用的是以免疫酶法检测EB病毒的IgA/VCA和IgA/EA抗体滴度。前者敏感度较高，准确性较低;而后者恰与之相反。故对疑及鼻咽癌者宜同时进行两种抗体的检测，这对早期诊断有一定帮助。对IgA/VCA滴度≥1：40和/或IgA/EA滴度≥1：5的病例，即使鼻咽部未见异常，亦应在鼻咽癌好发部位取脱落细胞或活体组织检查。如一时仍未确诊，应定期随诊，必要时需作多次切片检查。
(七)鼻咽侧位片、颅底片及CT检查 每例患者均应常规作鼻咽侧位照片和颅底照片。疑及鼻旁窦，中耳或其他部位有侵犯者，应同时作相应的摄片检查。有条件的单位应作CT扫描了解局部扩展情况，特别需要掌握的是咽旁间隙的浸润范围。这对于确定临床分期以及制定治疗方案都极为重要。鼻咽侧位片，见顶后壁软组织弥漫增厚或局部突出。颅底位片，若颅底骨质受侵犯，见边缘不规则的溶骨性缺损或孔道扩大。CT扫描 分辨率高，能清楚地显示软组织密度的肿块影及骨质破坏区，鼻咽旁各间隙病变的范围(图3)。眼眶、各鼻窦、翼腭窝和海绵窦受累的情况(图4)。CT检查对放射治疗的设计、手术方式选择和随访观察意义重大，应作为常规检查。
(八)B型超声检查 B型超声检查已在鼻咽癌诊断和治疗中广泛应用，方法简便，无损伤性，病人乐意接受。在鼻咽癌病例主要用于肝脏、颈、腹膜后和盆腔淋巴结的检查，了解有无肝转移和淋巴结密度、有无囊性等。
(九)磁共振成象检查 由于磁共振成象(MRl)可清楚显示头颅各层次、脑沟、脑回、灰质、白质和脑室、脑脊液管道、血管等，用SE法显示T1、T2延长高强度图像可以诊断鼻咽癌、上额窦癌等，并显示肿瘤与周围组织关系。
进行EB病毒相关抗体的检查可以了解疾病发生及发展状况。
